Halloween Costume ideas 2015

Un nuevo artículo del Instituto Biológico: «Familias enzimáticas — ¿una historia evolutiva compartida, o un diseño común?»


 
Me complace anunciar la publicación de un nuevo artículo del Instituto Biológico, una organización dedicada a la investigación de los límites de la evolución no dirigida y al avance del desarrollo de un nuevo paradigma biológico basado en el diseño inteligente. Este artículo, «Enzyme Families — Shared Evolutionary History or Shared Design? A Study of the GABA-Aminotransferase Family [Familias enzimáticas — ¿una historia evolutiva compartida, o un diseño común? Un estudio de laa familia de las GABA-aminotransferasas]», es el último capítulo de nuestro estudio a largo plazo de enzimas bacterianas para determinar si pueden cooptarse para nuevas funciones. La respuesta a esta pregunta es importante para el debate acerca de la evolución. Si las enzimas no pueden ser movilizadas para funciones genuinamente novedosas por medios no guiados, no importa cuán similares sean, la narrativa evolucionista es falsa.

Publicado en la revista BIO-Complexity, el trabajo fue realizado por Marci Reeves, Doug Axe y yo misma.

En un artículo anterior procedimos a describir la dificultad de la cooptación de la enzima Kbl para realizar la función de BioF. Las dos enzimas tienen una estructura muy parecida (véase más abajo) pero tienen dos diferentes reactividades químicas y diferentes funciones en la célula. Queríamos saber si una Kbl podía reemplazar una función BioF ausente. Después de cambiar casi cada aminoácido en el sitio activo de la Kbl (donde se llevan a cabo sus funciones químicas) para que se asemejase a BioF, la Kbl nunca pudo realizar la transformación a la función de la BioF.

(A) Dímero de BioF; (B) dímero de Kbl; (C) esqueletos de las dos enzimas alineadas entre sí; (D) el lado del aminoácido se encadena en el o en los sitio(s) activo(s) de cada enzima que lleva a cabo cada reacción — BioF se representa en azul, y Kbl se representa en verde. En rojo y naranja se representan los productos de reacción todavía en el o los sitio(s) activo(s).
En el artículo mencionado procedimos a expandir el trabajo para incluir a nueve de las enzimas más estrechamente relacionadas con BioF, incluyendo una que se supone que puede ejecutar tanto la química de la BioF como de la Kbl. Usando mutagénesis aleatoria, procedimos a ensayar cada mutación de base única en aquellos nueve genes. Ninguno de ellos se encontraba dentro de una mutación de cooptación. Pasamos a ensayar por cooptación las dos enzimas más susceptibles generando combinaciones de mutaciones sobre dos bases. Después de haber ensayado el 70 por ciento de todas las posibles mutaciones de dos bases para cada enzima, o alrededor de 40 millones de células de cada, esto también fracasó.

¿Qué significa esto? En un escenario evolutivo, para conseguir que una enzima cambie sus funciones el primer paso es hacer una copia de recambio que pueda mutar sin destruir una función que la célula necesita. En segundo lugar, la célula tiene que sobreproducir la enzima mutante, porque cualquier enzima emergente será al principio muy poco eficiente en su nueva función. Para compensar, tendrá que haber una gran abundancia de esta enzima. En tercer lugar, tenemos el problema de encontrar la combinación apropiada de mutaciones mediante una búsqueda aleatoria.

Tomado en conjunto, por cuanto no encontramos ninguna enzima que estuviera dentro de una mutación de la cooptación, la cantidad total de mutaciones necesarias es de al menos cuatro: una para duplicación, una para sobreproducción, y dos o más cambios simples de base. El tiempo de espera necesario para conseguir cuatro mutaciones es de 1015 años. Esto es más que la edad del universo. El verdadero tiempo de espera sería probablemente mucho mayor, por cuanto las dos enzimas candidatas más aparentes fracasaron en cooptar mediante mutaciones dobles.

Con esto, hemos afrontado dos objeciones planteadas por nuestros críticos: que no procedimos a ensayar la(s) mutación/mutaciones adecuada(s), y que no usamos el punto de partida adecuado. Procedimos a ensayar todos los posibles cambios simples de base en nueve enzimas diferentes, aquellas nueve enzimas que son estructuralmente más similares de toda la familia de la BioF. También procedimos al ensayo del 70 por ciento de dobles mutaciones en las dos enzimas más cercanas de estas nueve.

Finalmente, algunos hay dicho que deberíamos haber usado la enzima ancestral como nuestro punto de partida, porque creen que las enzimas modernas son algo diferentes de las antiguas. ¿Y por qué creen esto? Porque las enzimas modernas no pueden ser cooptadas a nada excepto a cambios triviales de función. En otras palabras, ¡no evolucionan!

Esto, precisamente, es lo que estamos exponiendo.

Publicar un comentario

MKRdezign

Formulario de contacto

Nombre

Correo electrónico *

Mensaje *

Con la tecnología de Blogger.
Javascript DisablePlease Enable Javascript To See All Widget